Действие ZONE разворачивается в Европе XIX века и рассказывает о "Они", строящем планы по уничтожению мира, при помощи созданных им "Тварях"  - человекоподобных существ, представляющих собой живые орудия зла и соединяющих в себе тело умершего человека и механические части. Сражаются с ним воины, входящие в состав Тёмной Религиозной Организации (Орден.)

Воины - это особенные люди, наделенные взаимосвязью с Духовной силой, божественной субстанцией, созданной много веков назад для того, чтобы бороться с созданиями Они (Тварями). Известно, что духовная Сила в виде 50 частей разбросана по городам. Как только частица духовной Силы вступит во взаимосвязь с подходящим человеком, она превращается в оружие для борьбы с Тварями.

Целью Они являются поиски так называемых "Осколков". Это особая форма духовной Силы и всего 5 осколков, они обеспечивают существование всех остальных 50 частей. Уничтожение осколков приведёт к уничтожению остальных частей.

В Ордене в это время царит полных хаос. За неделю твари погубили более 10 воинов - говорят, что все это творится в городе-призраке. Рик и Ева все ещё не вернулись с предыдущего задания, Бредли слишком занята тем, что помогает выжившим. Марк изучает файлы, полученные с ранних заданий. Выясняется, что в этом городе есть часть духовной энергии. Что дальше будет делать орден?